1991年香港黑幫龍頭倪坤被殺倪氏家族旗下五大頭目中除韓琛（曾志偉）外均伺機背叛發難不料卻被倪家不起眼的第二代倪永孝（吳鎮宇）不費一兵一卒牽制此舉引來重案祖督察黃志誠（黃秋生）的戒心使其派出警校學生陳永仁（余文樂）滲入倪家進行長期的臥底工作而韓琛為了鞏固勢力早在警察內部安插了線人劉建明（陳冠希）三年后事業蒸蒸日上的倪永孝為安枕無憂決意將五大頭目一舉殲滅卻因疏忽讓韓琛成為漏網之魚 　　1997年大難不死的韓琛重出江湖為替死去的同事報仇黃志誠找到他商議合作除掉倪永孝的事宜不久卻發現此舉鑄成大錯而各自為自己的尷尬身份苦惱的陳永仁和劉建明則在無間道的路上越行越遠